When Social Science Meets Ecology: A Uniq(+) journey

When Social Science Meets Ecology: A Uniq(+) journey

[Korean version below]

Research at the University of Oxford has always been my great white whale. However, through the Uniq+ graduate internship programme, I got to step into a new world of ecology research. Unbeknownst to me then, Ecology has been ever-present throughout my degree in International Relations and East Asian studies. Whether it be the critical security of glaciers or the politicisation of IPCC reports, my interests always danced between the interaction of social and natural sciences. Whilst I thought this interdisciplinarity held me back, working with the SalGo group opened my mind to how integral it is to cutting-edge environmental research.

Within the SalGo group, I worked on a project exploring how UAV multispectral data can be used to understand functional groups and species responses to different stressors and disturbances in grassland areas. My first few weeks focused on data processing, where I shifted through image replicates and compiled their data, such as treatment, plant type and plant height, to enable automatic labelling of plant species in a self-coded R script. This activity was accompanied by creating various meta-data to ensure these processes could be replicated in the future. Despite my limited experience in coding, I was excited by the prospects of learning new quantitative skills in R. A pivotal moment for me was visiting Wytham Woods for data collection and soil sample processing. Experiencing fieldwork was where all the dots connected, making me realise the profound connection between the data I was processing and the site of provenance. It was equally exciting to learn about all the other projects in the area, such as the Badger project, and the limitless potential of experiments in woodland areas.

I was particularly thrilled with the second aspect of my project, as it involved greater script development in Python and ImageJ. These scripts were tailored to process images, ensuring alignment, colour correction, and region of interest (ROI) selection are streamlined across all research lines: plot, species, and monoculture. With species-level images, we went further with flag finding and flag cropping scripts to single out inactive and active species within a quadrat. With these scripts, I had to meticulously test and fine-tune them, adapting to the diverse label formats tied to each research line. The debugging process presented challenges, but my willingness to untangle complex puzzles empowered my approach. After all, these meticulous steps will let us derive meaningful statistical analysis of different spectral features within different functional groups.

My time with the SalGo group and the Uniq+ programme ended with a conference-style presentation at the Examination Schools. While initially nervous, my time with Rob, Man, and Erola strengthened my confidence and enthusiasm for the research. I am incredibly grateful to work with a wonderful group who have taught me invaluable lessons. Lessons in puzzling out problems naturally and, in the face of uncertainty, see challenges as opportunities for growth and learning. Through attending various lab meetings, I saw in action how the collective wisdom of a team can spark remarkable insights. Grateful is an understatement for the experiences and the invaluable lessons I have gained.

I am incredibly thankful to Uniq+ and the SalGo team for continuing to constructively challenge some of the perceptions that can surround certain universities. Their support in empowering talented students from diverse backgrounds positively changes the narrative by providing insights into graduate life and research. I stand as living proof that increased access and inclusion at the highest levels can unlock future careers, confidence and skills like no other. I hope they continue to pave the way for future interns to achieve what they may think is impossible. I leave this project with an electrifying anticipation for the exciting academic odyssey and personal adventure that awaits. Onward and upward, here's to interdisciplinarity, breaking barriers and defying expectations!

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Fig 1. Yasmin presenting and answering questions on project research to the Uniq+ cohort at the Examination Schools, University of Oxford. 야스민은 옥스퍼드 대학교 E옥스퍼드 대학교 시험학교에서 유니크(+)  코호트에 프로젝트 연구에 대한 질문을 발표하고 답변하다.

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Fig 2. LivingOptics team and SalGo team spent the day at Wytham Woods trailing new hyper spectral technologies to examine plant community responses to climate change. 와이 탐 숲에 살아있는 광학과 살고 그룹이 하루를 함께 보내다.

By Yasmin Tarika Trivedi-Dave


Korean Translation:

사회과학과 생태학이 만나는 순간: 유니크(+) 여정

옥스포드 대학에서의 연구는 항상 저의 훌륭한 백고래다. 하지만 유니크+ 대학원 인턴십 프로그램을 통해 생태학 연구의 새로운 세계로 뛰어들게 되었다. 생태학은 제가 국제관계학과 동아시아학을 전공하는 내내 존재해 왔다. 빙하의 중요한 안전보장이든 IPCC 보고서의 정치화이든 간에 제 관심은 항상 사회과학과 자연과학의 상호작용 사이에서 춤을 추었습니다. 저는 이러한 학제적 협력이 저를 방해한다고 생각했지만,살고 그룹과 함께 일하는 것은 그것이 최첨단 환경 연구에 얼마나 필수적인지에 대한 제 마음을 열었다.

살고 그룹 내에서, 나는 무인 항공 다중 분광 데이터가 초원 지역의 다양한 스트레스 요인과 교란에 대한 기능적 그룹과 종의 반응을 이해하는 데 어떻게 사용될 수 있는지 탐구하는 프로젝트를 수행했다. 처음 몇 주 동안은 데이터 클리닝에 중점을 두었는데, 이미지 반복실험을 통해 스스로 코딩 된 R 스크립트로 자동 라벨링이 가능하도록 처리, 유형 및 키와 같은 데이터를 컴파일했다. 이 작업에는 이러한 과정이 미래에 복제될 수 있도록 보장하기 위한 다양한 메타 데이터 생성이 수반되었다. 코딩에 대한 제한된 경험에도 불구하고, 나는 R에서 새로운 정량적 기술을 배울 수 있다는 전망에 흥분했다. 나에게 중추적인 순간은 데이터 수집 및 토양 샘플 처리를 위해 위텀 우즈를 방문한 것이었다. 현장 작업을 경험하는 것은 모든 점들이 연결되는 곳이었고, 내가 처리하고 있는 데이터와 사이트 자체 사이의 깊은 연결을 깨닫게 했다. 오소리 프로젝트와 같은 이 지역의 다른 모든 프로젝트와 삼림 지역에서의 실험의 무한한 잠재력에 대해 알게 된 것도 마찬가지로 흥분되었다.

프로젝트의 두 번째 측면인 파이썬과 이미지J의 스크립트 개발을 포함하고 있었기 때문에 특히 감격스러웠다. 이 스크립트는 정렬, 색상 수정 및 관심 영역(ROI) 선택을 모든 연구 라인(그림, 종, 단일 배양)에서 간소화하여 이미지 처리에 적합했다. 종 수준의 이미지를 사용하여 플래그 찾기 및 플래그 자르기 스크립트로 더 나아가 쿼드랫 내에서 비활성 및 활성 종을 선별했다. 이 스크립트를 사용하여 각 연구 라인에 연결된 다양한 레이블 형식에 적응하면서 꼼꼼하게 테스트하고 미세 조정해야 했다. 디버깅 과정에서 어려움이 있었지만 복잡한 퍼즐을 풀고자 하는 의지가 제 접근 방식에 힘을 실어주었다. 결국 이 세심한 단계를 통해 다양한 기능 그룹 내에서 다양한 스펙트럼 특징에 대한 의미 있는 통계 분석을 도출할 수 있을 것이다.

살고 그룹과 유니크(+) 프로그램과 함께한 시간은 시험학교에서의 컨퍼런스 형식의 발표로 끝이 났다. 처음에는 긴장했지만 롭, 맨, 에롤라와 함께한 시간은 연구에 대한 자신감과 열정을 강화 시켰다. 저에게 소중한 교훈을 가르쳐준 훌륭한 그룹과 함께 일하게 된 것에 대해 믿을 수 없을 정도로 감사하다. 문제를 자연스럽게 해결하는 것에 대한 교훈과 불확실성에 직면한 도전을 성장과 배움의 기회로 간주하다. 다양한 실험실 회의에 참석하면서 저는 팀의 지혜가 어떻게 놀라운 통찰력을 불러일으킬 수 있는지를 실제로 보았다. 감사함은 제가 얻은 경험과 귀중한 교훈에 대한 절제된 표현이다.

옥스포드를 건설적으로 둘러쌀 수 있는 엘리트주의 특권에 도전을 계속해 준 유니크+와 롭과 그룹에 정말 감사드리다. 다양한 배경을 가진 재능 있는 학생들에게 힘을 실어주는 그들의 지원은 대학원 생활과 연구에 대한 통찰력을 제공함으로써 이야기를 긍정적으로 변화시키다. 저는 최고 수준의 접근성과 포용력이 다른 어떤 사람들처럼 미래의 직업과 자신감, 그리고 기술을 열어줄 수 있다는 살아있는 증거라고 생각하다. 저는 그들이 미래의 인턴사원들이 불가능하다고 생각되는 것을 성취할 수 있는 길을 계속 열어 주기를 바란다. 저는 이 프로젝트를 기다리고 있는 흥미진진한 학문적 오디세이와 개인적인 모험에 대한 흥분되는 기대감으로 남다. 우리 같이 장벽을 허물고 기대를 저버리지 않는 학제 간의 가능성을 위하여!